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安徽医院综合排名靠前的有
 
安徽医科大学第一附属医院、
 
安徽省立医院、
 
蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院、
 
安徽医科大学第二附属医院等。 
 
其中安徽医科大学第一附属医院拥有卫生部重点实验室数1个,省部重点实验室数10个,国家药物临床试验机构16个,国家卫健委专科、住院医师培训基地共42个,获批10个国家临床医学研究分中心和5个安徽临床医学研究中心,2020年度中国医院综合排行榜75位。 
 
安徽省立医院在最新一轮(2021年度)全国三级公立医院绩效考核排名第21位,等级A+;医院连续五年进入“复旦版中国医院排行榜”全国百强,健康管理中心排名全国第2。
 
蚌埠医学院第一附属医院作为省级医疗中心,在国家三级公立医院绩效考核中,连续四年位列全国百强。